如往常一样,旭日照耀下的大都会东京,突然发生了大规模的停电事故,继而威严耸立的都政厅发生大规模的爆炸。谁也不曾想到,这一切就是两名高中生所为。始作俑者九重新(石川界人配音)和久见冬二(齐藤壮马配音),童年时代曾因某个神秘计划相识,并经历了人生最初也最为刻骨铭心的记忆。不久前转学到东京的二人,通过网络发布恐怖袭击预告,肆无忌惮挑战警方的权威,而无意中在都政厅出现的同班同学三岛理沙(种崎敦美配音),受命运的驱使成为他们的共犯。另一方面,因政治案件而被打入冷宫的警视厅搜查一课杰出刑警柴崎健次郎(咲野俊介配音)最早觉察到预告视频和爆炸案的联系,在警署爆炸案之后,他被上司仓桥(手冢秀彰配音)召回搜查一课。警方很快得知一个惊人的消息,半年前青森核原料被劫案很可能与这两个神秘恐怖分子有关,东京危在旦夕