因为偷税事件,曾经处于精英组的百合根友久(冈田将生饰)被踢到早先成立的科学搜查班(ST)担任指挥官,通过之前的合作,虽然百合根始终未能完全接受青山翔(志田未来饰)、结城翠(芦名星饰)、黑崎勇治(漥田正孝饰)、山吹才藏(三宅弘城饰)以及ST实际领导者赤城左门(藤原龙也饰)这群怪人的行径,却也为他们自身那极度专业和见斥于周遭的气息所感染。百合根一面盼望早日回到搜查一课,一面又打算多守护ST的各位一段时间。随着作为后盾的三枝警官(渡部笃郎饰)的离开和ST新任监查松户紫织(濑户朝香饰)的到来,ST面临生死存亡的危机。赤门渐渐走出家门,百合根则成为遏止这头怪物不可或缺的重要存在本片根据今野敏的原作改编。